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在神經科學研究中，尤其是在體實驗，通常利用腺相關病毒（AAV）工具載體研究基因在神經系統中的功能作用，原因在于相較于其他基因運載工具，AAV病毒具有免疫原性低、安全性好并能實現基因的長效表達等優點。

腺相關病毒為單鏈DNA病毒（ssAAV）, 在入核、脫衣殼后，需要借助宿主DNA聚合酶或者分子間退火完成雙鏈轉化，才能啟動基因轉錄過程，這一過程限制了AAV載體介導的基因轉導，并直接影響病毒的感染效率。自身互補雙鏈 DNA 的腺相關病毒(scAAV)能夠克服這一限制，不需要經歷一個由單鏈變為雙鏈的過程，也就是說，雙鏈AAV病毒進入細胞后，可以直接表達，并且表達時間更快，表達水平更高。因此，在神經研究中，您也可以根據需要選擇scAAV載體，完成目的基因更快表達，或者基因更強表達的研究。

ssAAV & scAAV

根據啟動子的表達特征，我們通常將啟動子分為組成型啟動子、誘導型啟動子以及器官/組織特異性啟動子，這些啟動子各具特色。神經系統的組成及其復雜，腦部的精密研究非常關鍵。要想實現某個腦區甚至是某一類細胞特異性感染，選擇一種特異性相對更強的啟動子尤為重要。

①組成型啟動子

一般來自于管家基因，可連續不斷地啟動基因的表達。如巨細胞病毒啟動子CMV、CMV增強子融合的雞?-肌動蛋白啟動子CAG或泛素C啟動子UBC等等。

②誘導型啟動子

只有在一定的外界誘導或刺激作用下才能啟動基因的表達，如四環素啟動子TRE。

③器官/組織特異性啟動子

只有在特定的器官/組織中才能啟動基因的表達，下圖為大家列出的是一些常見的神經組織特異性啟動子：

除了啟動子外，AAV載體上其他元件的使用與優化也非常關鍵，尤其是轉錄后調控元件的添加，對于mRNA的剪接及核輸出、mRNA的穩定性及翻譯等具有重要意義，下面列舉兩個對于提高外源基因表達非常重要的轉錄后調控元件。

① 內含子

真核mRNA內含子在真核生物基因表達調控中起著重要的作用，是轉基因研究中提高外源基因表達的重要元件之一。在多數情況下，真核mRNA內含子的存在可以提高基因的表達水平，因為其剪接過程會影響mRNA新陳代謝的多個階段，包括轉錄、RNA編輯、pre-mRNA的加工、mRNA的出核運輸、翻譯等。所以說，在載體容量允許的情況下可添加一個內含子，有助于刺激基因的表達。

② WPRE元件

土撥鼠肝炎病毒轉錄后調節序列WPRE是一段順式作用的RNA元件，放在多聚腺苷酸化信號之前可顯著增加mRNA的表達水平和翻譯效率，進而增強基因的表達，并且WPRE插入病毒載體中還可以大大提升病毒包裝的滴度。然而由于WPRE序列較長（600bp左右），所以還需要視具體的載體容量選擇性插入。