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知識分享‖神經環路示蹤技術的發展歷程


Hagmann P,et al.,PLoS Biology,2008

腦是人體最神秘、最復雜的器官,由近1011個神經元組成,形成約1014-15個突觸,這種復雜的神經環路網絡為認知、情感、記憶、感覺和運動等大腦高級功能建立了穩固的結構基礎。如何認識神經元的連接方式,描繪神經環路的精細結構并認知其功能對于了解大腦的復雜功能至關重要。科學家們一直致力于找到可以特異性標記細胞種類、傳導方向可控、可視化的示蹤工具,以期實現對神經環路網絡的精確認識和研究。

利用神經示蹤工具實現對神經環路的精確標記,主要涉及兩大基本問題即方向性(順向、逆向)和是否跨突觸。順向(Anterograde)是由注射部位的神經元胞體經軸突下行至末梢,逆向(Retrograde)是由軸突末梢傳到細胞體;順向跨突觸是從胞體傳到軸突末梢后跨過突觸傳遞至下一級神經元,逆向跨突觸跟順向跨突觸相反,是由胞體逆向跨突觸傳遞至上一級神經元的軸突。如下圖所示:


Strick P L,et al.,eLS,2011


V帶領大家一起了解神經環路示蹤工具的發展歷程,共同感受神經科學研究領域的飛速進步。



傳統神經示蹤工具


最早的神經示蹤劑是放射性標記的氨基酸,如氚化亮氨酸和脯氨酸,用取代化合物分子的一種或幾種原子而使它能被識別并可用作示蹤劑,利用放射性探測技術來追蹤這些示蹤劑,但放射性標記示蹤劑很快被光學顯微鏡可檢測的示蹤劑所超越。這些用途廣泛、敏感性強,并能選擇性進行順行、逆行標記的物質被應用到神經環路的研究中,成為傳統示蹤劑,如染料、蛋白質和肽類標記物等。種類主要有:

種類

名稱

特點

辣根過氧化物酶

辣根過氧化物酶(HRP)

逆行示蹤劑,染色局限于細胞體和初生樹突

蛋白

霍亂毒素B亞基(CTb)

逆行示蹤劑,無毒

熒光染料

熒光金(Fluoro Gold)

逆行示蹤劑顯示樹突分支,易觀察,不易擴散

羰化青Dil

逆行示蹤劑顯示軸突,熒光強而穩定,無毒,不易擴散

生物素

生物素化葡聚糖胺BDA

順行示蹤保存時間長,可與多種熒光示蹤劑及免疫組化技術相結合

凝集素

麥芽凝集素(WGA)、菜豆凝集素(PHA)

順行示蹤劑注射后需要較長的存留時間才能實現轉運

上述這些傳統的示蹤劑被廣泛用于確定實驗動物不同腦區之間神經元的連接,促進了人們對大腦神經網絡結構的認識,但它們仍有以下缺點:無法特異性標記細胞類型幾乎沒有跨突觸能力不能用于傳遞外源基因難以用于多個腦區、多種類型神經元通過突觸連接形成的復雜神經網絡研究。

病毒示蹤劑的出現為上述問題的解決提供了新方案,并成為追蹤神經網絡連接的有效工具。


病毒示蹤工具


應用于神經環路標記的病毒示蹤工具大多由嗜神經病毒改造而來。嗜神經病毒能感染神經細胞,沿神經環路跨突觸傳播,這些特點使其成為繪制神經環路的理想工具。常用的嗜神經病毒示蹤工具主要有單純皰疹病毒Herpes simplex virus,HSV偽狂犬病毒Pseudorabies virus,PRV狂犬病毒Rabies virus,RV水泡性口炎病毒Vesicular stomatitis virus,VSV 其特點如下表所示:

病毒名稱和描述

順向跨突觸病毒

HSV

dsDNA~152kb包裝容量~130kb毒力和傳播方向具有菌株依賴性。H129株優先順向跨突觸示蹤

VSV

-ssRNA,11-12kb包裝容量<6kb對人的毒性較低,極短時間高豐度表達目的蛋白,可被其他病毒的囊膜糖蛋白包裝而獲得不同方向的跨突觸能力

逆向跨突觸病毒

RV

-ssRNA11.9kb包裝容量<6kb要標記神經元,可導致致命的人畜共患疾病。改造的復制缺陷型RV毒性較低

PRV

dsDNA~150kb包裝容量~130kb不能感染高等靈長類;野生型PRV毒性極高且雙向傳播。改造的PRV-Bartha株逆行跨突觸示蹤毒性較低

上述嗜神經病毒在神經環路的標記中具有很強的感染性和特異性,但其免疫原性很強,對細胞的毒害性亦大:感染一段時間后會導致神經元病變,甚至可導致被感染實驗動物死亡,對環境和實驗人員存在潛在危險,需在生物安全2級以上實驗室操作,所以在使用嗜神經病毒進行研究時仍需慎重。因此,開發一種免疫原性及毒副作用極低的神經示蹤工具病毒是非常有必要的。
腺相關病毒(Adeno-associated virus,AAV是目前已發現的結構最簡單的一類單鏈DNA復制缺陷型病毒,具有安全性高、免疫原性低、宿主細胞范圍廣和在體內表達時間長等特點。科學界現普遍認為AAV不會導致人類疾病,是目前最有前景的基因治療載體。
基因工程化的AAV能轉導外源基因,借助特定啟動子、光遺傳學/化學遺傳學元件、鈣指示劑、神經遞質探針或Cre/lox P,Flp/FRT重組酶技術,可選擇性地標記特定的神經元。越來越多的神經環路研究使用AAV作為神經示蹤工具。

AAV血清型種類多,不同的血清型對神經元有不同的感染特性。神經科學研究中常用的AAV血清型有2589DJ1/2PHPAnc80等,它們有高效轉導神經元的能力,可根據標記的神經元選擇合適的AAV血清型此外,科學家也一直致力于AAV新血清型的開發研究,近日國際基因治療領域著名專家高光坪教授及其課題組鑒定出一種新AAV血清型AAVv66其與AAV2具有高度序列相似性,但比AAV2產率更高、病毒穩定性更高及更好的中樞神經系統轉導能力,通過顱內和全身注射給藥時AAVv66在腦組織內分布較AAV2更好

常見的AAV病毒載體都是順向非跨突觸標記,AAV的逆向非跨突觸和順向跨突觸標記能力在科學家的潛心研究下取得了滿意成果,并被廣大研究者用于神經環路研究:


  • rAAV2-retro(逆向非跨突觸標記)

2016D. GowanlockR. Tervo等通過定向進化的方法構建了一種新的AAV變體 rAAV2-retro該變體具有逆行示蹤能力且效率與傳統的逆行示蹤劑相當,由此AAV的逆向非跨突觸標記能力被成功開發。下圖所示為rAAV2-retro的開發過程及應用實例:

Tervo et al.,Neuron,2016


  • AAV1順向跨突觸示蹤

2017張礪教授團隊研究報道AAV1在高滴度條件下呈順向跨突觸傳播,與Cre依賴的報告系統相結合,可高效和特異性地驅動Cre依賴的外源基因在突觸后神經元中表達,標記突觸后神經元。2020年該研究團隊再次深入研究了AAV1順向跨突觸標記的作用機制——依賴于突觸囊泡的釋放,同時揭示了其在多種神經環路中的廣泛應用,為AAV作為順向跨突觸示蹤病毒工具對神經元及其投射腦區進行標記提供了諸多證據。我們相信AAV在神經環路中的應用將會越來越廣泛。研究所用的AAV病毒部分由維真生物提供,欲知詳情請點擊往期回顧:

AAV轉導神經元需要宿主細胞合成其基因的互補鏈,因此基因的高表達需要較多病毒顆粒和較長時間才能實現。雙鏈AAV(self-complementary AAVscAAV) 進入細胞后,不需要由單鏈變為雙鏈的過程,基因表達更為快速,表達水平更高,不過scAAV的裝載量只有單鏈AAV的一半例如2020年張礪教授團隊的科研論文就使用了scAAV證實了scAAV1-hSyn-Cre具有更優越的順向跨突觸標記能力,可在興奮性、抑制性、神經調質和腦-脊髓等多種神經環路中有效、特異地標記單突觸靶神經元及其輸出,從而解析不同的功能/行為。

總 結

理論,只要病毒能感染神經系統,就具備開發成工具病毒的潛力,但是每種神經示蹤病毒都有其特異的跨突觸標記特性和局限性,雖然病毒示蹤工具在神經環路研究中的應用最為廣泛,對神經示蹤病毒改造也已取得了顯著的進展,但仍有許多問題亟待解決,例如病毒跨突觸機制跨突觸的過程及其對各類型突觸結構的選擇性跨多突觸標記的神經網絡如何區分連接級數等。針對上述問題,科學家們一直努力研究改造病毒,以期獲得毒性更低感染、傳播、跨突觸機制更加明確的神經示蹤工具病毒為腦科學研究提供更強大工具



維真生物神經示蹤工具AAV產品及服務



如有需要,歡迎致電400-077-2566

產品編號

產品名稱

AV204006-AVretro

AAVretro-hSyn-Cre

AV204006-AV1

AAV1-hSyn-Cre

AV204046-AV1

scAAV1-hSyn-Cre

AV204006-AV2retro

AAV2 retro-hSyn-Cre

AV204049-AV1

AAV1-hSyn-Flp

AV204050-AV1

AAV1-CAG-DIO-Flp

AV204054-AV1

AAV1-EF1a-DIO-Flp

……

熒光蛋白(標記神經元)

AV200001-AV2retro

AAV2 retro-CMV-GFP

AV200007-AV2retro

AAV2 retro-hSyn-GFP

AV200109-AV1

(Cre依賴)

AAV1-CAG-DIO-GFP

AV200160-AV2

(Cre依賴)

AAV2-CAG-DIO-mCherry

AV200145-AV9

(Cre依賴)

AAV9-EF1a-DIO-mCherry

AV200096-AV2

(Cre依賴)

AAV2-hSyn-DIO-GFP

AV200096-AV9

(Cre依賴)

AAV9-hSyn-DIO-GFP

AV200146-AV9

(Cre依賴)

AAV9-hSyn-DIO-mCherry

AV200117-AV9

(Cre依賴)

AAV9-CaMKIIa-DIO-GFP

AV200147-AV5

(Cre依賴)

AAV5-CaMKIIa-DIO-mCherry

AV200147-AV9

(Cre依賴)

AAV9-CaMKIIa-DIO-mCherry

……

光遺傳學(操控神經元)

AV201006-AV2

(Cre依賴)

AAV2-EF1a-DIO-hChR2(H134R)-mCherry

AV201006-AV9

(Cre依賴)

AAV9-EF1a-DIO-hChR2(H134R)-mCherry

AV201007-AV2

(Cre依賴)

AAV2-EF1a-DIO-hChR2(H134R)-EYFP

AV201007-AV9

(Cre依賴)

AAV9-EF1a-DIO-hChR2(H134R)-EYFP

AV201017-AV9

(Cre依賴)

AAV9-EF1a-DIO-eArch3.0-EYFP

AV201021-AV9

(Cre依賴)

AAV9-EF1a-DIO-eNpHR3.0-EYFP

AV201003-AV2

(Cre依賴)

AAV2-CaMKIIa-DIO-hChR2(H134R)-mCherry

……

化學遺傳學(操控神經元)

AV202014-AV9

(Cre依賴)

AAV9-EF1a-DIO-hM4D(Gi)-mCherry

AV202010-AV9

(Cre依賴)

AAV9-hSyn-DIO-hM4D(Gi)-mCherry

AV202015-AV9

(Cre依賴)

AAV9-CaMKIIa-DIO-hM4D(Gi)-mCherry

……

鈣指示劑(神經元成像)

AV203009-AV2retro

(Cre依賴)

AAV2-retro-EF1a-DIO-GCaMP6m-P2A-nls-dTomato

AV203006-AV8

(Cre依賴)

AAV8-EF1a-DIO-GCaMP6s-P2A-nls-dTomato

AV203006-AV9

(Cre依賴)

AAV9-EF1a-DIO-GCaMP6s-P2A-nls-dTomato

AV203009-AV8

(Cre依賴)

AAV8-EF1a-DIO-GCaMP6m-P2A-nls-dTomato

AV203009-AV9

(Cre依賴)

AAV9-EF1a-DIO-GCaMP6m-P2A-nls-dTomato

AV203009-AV DJ

(Cre依賴)

AAV-DJ-EF1a-DIO-GCaMP6m-P2A-nls-dTomato

AV203016-AV9

(Cre依賴)

AAV9-EF1a-DIO-GCaMP6f-P2A-nls-dTomato

AV203004-AV5

(Cre依賴)

AAV5-hSyn-DIO-GCaMP6s-P2A-nls-dTomato

AV203046

AAV-EF1a-DIO-jGCaMP7b-P2A-nls-dTomato

AV203047

AAV-EF1a-DIO-jGCaMP7c-P2A-nls-dTomato

AV203048

AAV-EF1a-DIO-jGCaMP7s-P2A-nls-dTomato

AV203049-AV9

(Cre依賴)

AAV9-EF1a-DIO-jGCaMP7f-P2A-nls-dTomato

……

另有AAV9AAV-PHP.BAAV-PHP.eB等可跨血腦屏障的血清型AAV產品。關注我們了解更多產品詳情~



Reference


1. Saleeba, C., et al., A Student's Guide to Neural Circuit Tracing. Front Neurosci, 2019. 13: p. 897.

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7.Hsu, H., Brown, A., Loveland, A.B. et al. Structural characterization of a novel human adeno-associated virus capsid with neurotropic properties. Nat Commun 11, 3279 (2020).

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